All modules for which code is available
- agavepy.agave
- attrdict.dictionary
- datacatalog.agavehelpers
- datacatalog.compositions.catalog.schemas
- datacatalog.compositions.sample_set.schemas
- datacatalog.definitions.schemas
- datacatalog.dicthelpers
- datacatalog.extensible
- datacatalog.filetypes.anytype
- datacatalog.filetypes.filetype
- datacatalog.filetypes.infer
- datacatalog.filetypes.listing
- datacatalog.filetypes.mime
- datacatalog.filetypes.rules
- datacatalog.filetypes.schemas
- datacatalog.filetypes.unknown
- datacatalog.filetypes.validate
- datacatalog.formats.biofab.convert
- datacatalog.formats.caltech.convert
- datacatalog.formats.classify
- datacatalog.formats.converter
- datacatalog.formats.ginkgo.convert
- datacatalog.formats.ginkgo.mappings
- datacatalog.formats.marshall.convert
- datacatalog.formats.runner
- datacatalog.formats.sample_attributes.convert
- datacatalog.formats.schemas
- datacatalog.formats.transcriptic.convert
- datacatalog.githelpers
- datacatalog.hashable.jsoncache
- datacatalog.hashable.picklecache
- datacatalog.identifiers.abaco.actorid
- datacatalog.identifiers.abaco.execid
- datacatalog.identifiers.abaco.hashid
- datacatalog.identifiers.abaco.nonceid
- datacatalog.identifiers.abaco.schemas
- datacatalog.identifiers.agave.appid
- datacatalog.identifiers.agave.schemas
- datacatalog.identifiers.agave.uuids
- datacatalog.identifiers.identifier
- datacatalog.identifiers.interestinganimal
- datacatalog.identifiers.schemas
- datacatalog.identifiers.tacc.schemas
- datacatalog.identifiers.tacc.username
- datacatalog.identifiers.tests.test_typed_uuid
- datacatalog.identifiers.typeduuid.schemas
- datacatalog.identifiers.typeduuid.typeduuid
- datacatalog.identifiers.typeduuid.uuidtypes
- datacatalog.jsonschemas.coll
- datacatalog.jsonschemas.encoders
- datacatalog.jsonschemas.formatchecker
- datacatalog.jsonschemas.objects.pjso
- datacatalog.jsonschemas.schema
- datacatalog.jsonschemas.schemas
- datacatalog.jsonschemas.validate
- datacatalog.linkages
- datacatalog.linkedstores.annotation.annotation
- datacatalog.linkedstores.annotation.inline
- datacatalog.linkedstores.annotation.schemas
- datacatalog.linkedstores.annotation.store
- datacatalog.linkedstores.annotations.exceptions
- datacatalog.linkedstores.annotations.tag.document
- datacatalog.linkedstores.annotations.tag.schemas
- datacatalog.linkedstores.annotations.tag.store
- datacatalog.linkedstores.annotations.text.document
- datacatalog.linkedstores.annotations.text.schemas
- datacatalog.linkedstores.annotations.text.store
- datacatalog.linkedstores.association.document
- datacatalog.linkedstores.association.exceptions
- datacatalog.linkedstores.association.schemas
- datacatalog.linkedstores.association.store
- datacatalog.linkedstores.basestore.admin
- datacatalog.linkedstores.basestore.agaveclient
- datacatalog.linkedstores.basestore.diff
- datacatalog.linkedstores.basestore.documentschema
- datacatalog.linkedstores.basestore.exceptions
- datacatalog.linkedstores.basestore.extensible
- datacatalog.linkedstores.basestore.heritableschema
- datacatalog.linkedstores.basestore.linkmanager
- datacatalog.linkedstores.basestore.managedfields
- datacatalog.linkedstores.basestore.merge
- datacatalog.linkedstores.basestore.mongomerge
- datacatalog.linkedstores.basestore.ratelimit
- datacatalog.linkedstores.basestore.record
- datacatalog.linkedstores.basestore.schemas
- datacatalog.linkedstores.basestore.softdelete
- datacatalog.linkedstores.basestore.store
- datacatalog.linkedstores.basestore.strategies
- datacatalog.linkedstores.challenge_problem.mappings.gdrive.errors
- datacatalog.linkedstores.challenge_problem.mappings.gdrive.gdrive
- datacatalog.linkedstores.challenge_problem.mappings.gdrive.google_utils
- datacatalog.linkedstores.challenge_problem.mappings.gdrive.quickstart_service
- datacatalog.linkedstores.challenge_problem.schemas
- datacatalog.linkedstores.challenge_problem.store
- datacatalog.linkedstores.experiment.mappings.gdrive.errors
- datacatalog.linkedstores.experiment.mappings.gdrive.gdrive
- datacatalog.linkedstores.experiment.mappings.gdrive.google_utils
- datacatalog.linkedstores.experiment.mappings.gdrive.quickstart_service
- datacatalog.linkedstores.experiment.schemas
- datacatalog.linkedstores.experiment.store
- datacatalog.linkedstores.experiment_design.mappings.gdrive.errors
- datacatalog.linkedstores.experiment_design.mappings.gdrive.gdrive
- datacatalog.linkedstores.experiment_design.mappings.gdrive.google_utils
- datacatalog.linkedstores.experiment_design.mappings.gdrive.quickstart_service
- datacatalog.linkedstores.experiment_design.schemas
- datacatalog.linkedstores.experiment_design.store
- datacatalog.linkedstores.file.schemas
- datacatalog.linkedstores.file.store
- datacatalog.linkedstores.fixity.exceptions
- datacatalog.linkedstores.fixity.indexer
- datacatalog.linkedstores.fixity.schema
- datacatalog.linkedstores.fixity.schemas
- datacatalog.linkedstores.fixity.store
- datacatalog.linkedstores.measurement.schemas
- datacatalog.linkedstores.measurement.store
- datacatalog.linkedstores.pipeline.exceptions
- datacatalog.linkedstores.pipeline.schema
- datacatalog.linkedstores.pipeline.schemas
- datacatalog.linkedstores.pipeline.serializer
- datacatalog.linkedstores.pipeline.store
- datacatalog.linkedstores.pipelinejob.exceptions
- datacatalog.linkedstores.pipelinejob.fsm
- datacatalog.linkedstores.pipelinejob.graphfsm
- datacatalog.linkedstores.pipelinejob.job
- datacatalog.linkedstores.pipelinejob.mappings
- datacatalog.linkedstores.pipelinejob.schema
- datacatalog.linkedstores.pipelinejob.schemas
- datacatalog.linkedstores.pipelinejob.store
- datacatalog.linkedstores.process.schemas
- datacatalog.linkedstores.process.store
- datacatalog.linkedstores.product.schemas
- datacatalog.linkedstores.product.store
- datacatalog.linkedstores.reference.schemas
- datacatalog.linkedstores.reference.store
- datacatalog.linkedstores.sample.schemas
- datacatalog.linkedstores.sample.store
- datacatalog.linkedstores.structured_request.document
- datacatalog.linkedstores.structured_request.schemas
- datacatalog.linkedstores.structured_request.store
- datacatalog.logger
- datacatalog.managers.annotations.anno
- datacatalog.managers.catalog.catalog
- datacatalog.managers.common
- datacatalog.managers.pipelinejobs.config
- datacatalog.managers.pipelinejobs.exceptions
- datacatalog.managers.pipelinejobs.indexer
- datacatalog.managers.pipelinejobs.indexrequest
- datacatalog.managers.pipelinejobs.instanced
- datacatalog.managers.pipelinejobs.jobmanager
- datacatalog.managers.pipelinejobs.reactor
- datacatalog.managers.pipelinejobs.store
- datacatalog.managers.sampleset.processor
- datacatalog.mongo.encodeauthn
- datacatalog.mongo.manage_views
- datacatalog.mongo.mongo
- datacatalog.pathmappings.levels
- datacatalog.pathmappings.stores
- datacatalog.settings
- datacatalog.slots.client
- datacatalog.slots.dbkey
- datacatalog.slots.logger
- datacatalog.slots.record
- datacatalog.stores.agave
- datacatalog.stores.exceptions
- datacatalog.stores.level
- datacatalog.stores.managed
- datacatalog.stores.pathmapping
- datacatalog.tenancy.classes
- datacatalog.tenancy.funcs
- datacatalog.tenancy.projects
- datacatalog.tenancy.schemas
- datacatalog.tenancy.tenants
- datacatalog.tokens.admin
- datacatalog.tokens.classes
- datacatalog.tokens.exceptions
- datacatalog.tokens.salt
- datacatalog.tokens.token
- datacatalog.utils
- datacatalog.views.aggregations
- logging
- pymongo.errors